في الأساطير اليونانية القديمة، قام الإغريق بحصار طروادة مدّة عشر سنوات، واستعصت عليهم ولم يستطيعوا الدّخول إليها لشِدَّة ارتفاع أسوارها ومتانتها. ثم جاءت للإغريق فكرة عبقرية؛ فقاموا ببناء حصانٍ خشبي ضخمٍ جداً، يتجاوز ارتفاعه المئة متر؛ ووزنه يزيد عن ثلاثة أطنان؛ وكان مجوَّفاً من الداخل، ووضعوا الجنود في داخل الحصان الخشبي ووضعوا الحصان أما بوابة طروادة. ظنَّ الطرواديون أن هذا الحصان هو دليل سلام من الإغريقيين، فقاموا بإدخاله داخل أسوارهم واحتفلوا في ذلك اليوم بانتصارهم على الإغريق.
وبعد انتهاء الاحتفالات في الليل، نزل الجنود المختبئون في الحصان الخشبي وقاموا بقتل من قابلهم من الجنود وفتحوا البوابات وأدخلوا بقية الحيش الإغريقي، فقاموا بنهب المدينة وأخذ كل النساء والأطفال كعبيدٍ لهم، وكل هذه الحرب لأنّ أميراً من طروادة قام بخطف زوجة ملك إسبارطة الخائنة لأنّه أحبها، وأخذها معه إلى طروادة ليعيشا فيها. هذه القصة موجودة في الإلياذة التي رواها هوميروس، وأصحبت من أشهر قصص الخدع في الحرب.
في وقتنا الحاضر، يتم استخدام مصطلح "حصان طروادة" كناية عن الخدعة والاحتيال. وفي زمننا الحالي يوجد نوع من قرصنة الحواسيب اُطلِق عليها مصطلح حصان طروادة، أو كما يسميها العامة "تروجن"، وهي عبارة عن برنامج كمبيوتر ذو شيفرة خاصة، يتم زرعة في الحاسوب ليقوم بأعمال غير مرغوبة لصاحب الحاسوب، كالتجسُّس على محتويات جهازه أو إضعافه؛ وفي بعض الحالات محو البيانات الموجودة أو حتى إتلافه بالكامل. وسبب التسمية تأتي من القصة الأصلية، فالبرنامج التروجن يدخل الجهاز كبرنامج عادي له وظائف محددة، ثم يبدأ بالأعمال التخريبية أو التجسُّسِية التي صُمِّمَ لها.