اقسمها يا اختاه إلى اربع انواع مبنية على بنية البروتين نفسه وهي كالآتي
بنية أولية: تحددها تسلسل الأحماض الأمينية
بنية ثانوية: تتألف من بنى ثانوية تتشكل من التفاف السلاسل الببتيدية على بعضها بشكل حلزونات ألفا وصفائح بيتا.
بنية ثالثية: وهي ما يحدد شكل البروتين النهائي، تتألف من اجتماع البنى الثانوية للبروتين (لوالب ألفا وصفائح بيتا) بوساطة قوى فيزيائية غير تكافؤية لتعطي الشكل النهائي للبروتين
بنية رابعية: يستخدم عادة هذا المصطلح للدلالة على البنية التي تكونها اتحاد سلسلستين ببتيديتين أو أكثر في ما يسمى الوحدة البروتينية، مثال: الهموجلوبين.